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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T体受损受损細胞系可能正常鉴别淋巴肿癌体受损受损細胞系外壁的首要进行相匹配性混合体(MHC)呈递的抗原而开启免役不起反应。MHC I类(MHC-I)原子结构与CD8+ T体受损受损細胞系能够 反应,其呈递的肽首要收入于内源性胞质蛋清的蛋清酶体挥发,而MHC II类(MHC-II)原子结构首要传达于专注抗原提呈体受损受损細胞系,与CD4+ T体受损受损細胞系能够 反应,其呈递的肽出于实现内体方式挥发的胞外和胞内蛋清(图1)。故此,正常鉴别由MHC原子结构呈递的淋巴肿癌抗原相对 设计依赖症T体受损受损細胞系正常鉴别和杀灭淋巴肿癌体受损受损細胞系的高效和稳定的肺癌免役治疗是至关必要的。通过质谱(MS)的免役肽组学(Immunopeptidomics)可能从许多体受损受损細胞系系、淋巴肿癌进行和键康进行中高通芯片量、随便检验MHC整合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力含有MHC下列不属于搭配肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫性肽回文序列及其当地翻译后呈现内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序技术应用,不依赖现有数据库,更多通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富性的数据报告研究主要内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的手段

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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案例分享浅析

01 策略调查

短文提题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

刊出异物:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)都是种核读取球蛋白,在癌症复发中长期过把你想表达出来,做以为恶性肿瘤引发的推动主观因素。现如今,靶向治疗XPO1的小原子核正被应用于临床治疗防癌食用的药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 那种来于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肿癌-免疫系统的治疗

好文章大题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发布报纸:Nature Communications IF:16.6 2023

恶变胸膜间皮瘤(MPM)就是种的疗效缺陷的侵入性肿癌。会因为主要的制疗解决方案贫乏的疗效,往往十分困难必须 新的制疗方案。上述情况其T内部浸泡,作家统计假设MPM就是个适合自己的制疗性肿瘤肺炎疫苗的总体目标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用基本概念质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶性瘤胸膜间皮瘤免疫性肽组学测量

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 疾病mRNA狂犬疫苗制作

好文章主题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

刊登报纸:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过根据质谱的免役肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌感柒的Hela组织和HCT-116组织中认定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体肽组学是球营养物质组学的两个迅猛发展方向的旁支,它致力于探究天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体系统中由主要进行机构相融性黏结体(MHC)或人类红生殖生殖组织神经细胞膜抗原(HLA)分子结构呈递的天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体肽。这样的天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体肽是生殖生殖组织神经细胞膜表明呈递的肽段,也能被T生殖生殖组织神经细胞膜判别,然而引起天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体表现。来源于质谱的天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体肽组学己经加入签别MHC球蛋白酶呈递肽的金原则的方法,也能就直接签别各个身理和病理报告阶段下各个进行机构和生殖生殖组织神经细胞膜品类中的天然免疫性组织神经细胞检测生殖生殖组织神经细胞系统抗体肽组,列举实物瘤或病毒码患上的生殖生殖组织神经细胞膜。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫细胞肽组查重精准服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,才能明确且马上具备免疫检测性肽编码序列,发掘太多非明显免疫检测性肽,逐一筛分出稳定新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

参考资料论文论文参考文献

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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