
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物工程 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
调查最终
科学研究相关人员实验设计渐渐冷冻箱时长加长牛羊肉的对抗强度、持混流式水轮机、色度、分离铁占比、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4横向来评估报告脂肪机构細胞的铁身故环境。结果提示 提示 ,冷冻箱时长加长后,牛羊肉的对抗强度在第六天和第6天偏态回落;持水效果降底;字体颜色变深,失掉光泽感,鲜网红变的暗网红。另外,分离铁、活力氧和MDA的占比偏态提升,細胞凋亡率偏态变高。 探究工人截取各个冷冻箱日期的肌土样的营养素酶质,接下来去SDS-PAGE探讨,营养素酶质条带在各个晚清时期数据分布透亮且类似于(图1a)。依据营养素酶在各个土样中的描述前提,探讨发现同样组土样的中数字靠近于同样含量(图1b),解释肌土样营养素酶质享有顺畅的组内类似于性和组间区别性。 核球淀粉酶酶质组学共签定出1996种核球淀粉酶酶质。以B0为对应组,需求B1、B2、B4和B6中的核球淀粉酶酶完成一定的相互影响表达出方式方式剖析,共签定到37七个DEPs。将火山图web3d,并结合FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根规范剖析DEP。的最后长为1c-f表达出方式,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别签定出22、33、73和140个DEPs,其中的分刘海别上浮6、11、32和8七个,调整16、22、41和54个。聚类算法方式测评了与众不同冷冻箱第一阶段相关肌肤集体中核球淀粉酶酶质的表达出方式方式,的最后表现相关肌肤核球淀粉酶酶表达出方式方式一定的相互影响发生变化储放时刻的添加而添加(图1g)。
图1| 各不相同保温时段的手臂肌肉样本核氨基酸组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 其他冷藏箱时间间隔的肌肉组织样件之间的关系血清介绍(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋清肽的PRM降钙素原检测浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用于KEGG丰度之间的关系表达方法蛋清的铁枯死长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT定量分析淀粉酶质组学水平性产品设备,拜谱海洋生物已生产制造完成任务并加入了进一步完善成长期的转录组学、淀粉酶组学、新陈代谢组学同时几组学协同产品设备水平性产品设备制度,欢迎致电咨询!
参考选取文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.